Le contre la montre par équipe fait son retour sur la Grande Boucle. Une modification est toutefois apportée à lexercice chronométré collectif, pour lequel les temps enregistrés sur la ligne seront pris en compte sans aucun barème. Sur le Tour 2009, le temps réel reste une règle intangible. Cest aussi pour cette raison que le parcours dessiné à Montpellier rentre dans un format court.